Het Programma Hoogfrequent Spoor (PHS), en met name de herroutering van goederentreinen, heeft in Oost-Nederland geleid tot veel maatschappelijke onrust. Dit werd duidelijk tijdens een bestuurlijke conferentie van betrokken gemeenten, regio's en provincies in Gelderland en Overijssel. Belangrijk punt is dat het kabinetsbesluit geen garanties geeft voor de leefbaarheid langs de betrokken spoorlijnen in Oost-Nederland.

De gemeente Deventer heeft in een brief aan de betrokken ministers haar zorgen uiteengezet. De bezwaren zijn onder andere dat de gemeente pas in een laat stadium geïnformeerd is over de plannen, en dat de begroting onrealistisch is. Het concept staat haaks op eind jaren '90 gemaakte keuzes: De Knoop zal fors moeten worden aangepast en ook woningen moeten voor het project wijken. Hierdoor is er voor tientallen miljoenen kapitaalvernietiging van investeringen.